Поки світ стрімко змінюється під впливом цифрових технологій, «Цілодобова книгарня містера Пенумбри» постає як міст між минулим і майбутнім. Це місце, де сторінки зберігають не лише знання, а й вікові таємниці. Безробітний вебдизайнер влаштовується нічним продавцем у цю загадкову книгарню, що майже не має покупців, але сповнена дивних старовинних книг і ще дивніших відвідувачів. Його нова робота поступово перетворюється на захопливу пригоду на межі реальності й технологічної магії. Поступово загадкові книжки й сам містер Пенумбра ведуть героя до розкриття таємної організації, яка існує вже 500 років.